Si dal momento in cui setti il valore della variabile giusta.

codice:
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<html>
<head>
<title>Untitled</title>
</head>
<body>
<input type="hidden" id="var1">
<input type="hidden" id="var2">
<script language="JavaScript" type="text/javascript">
<!--
var1.value = "ciao";
var2.value = "buondi";
document.write(var1.value);
document.write(" ");
document.write(var2.value);
//-->

</script>
</body>
</html>