Dovresti mettere qualche parentesi graffa del while, in quel modo ti esegue solo la riga successiva
codice:
$query = "select a.titolo_libro as titolo, b.nome_autore as nome, b.cognome_autore as cognome from libri a, autori b where a.autore_id = b.autore_id"; 
$dbResult = mysql_query($query, $db); 
$AffectedRows = mysql_affected_rows($db); 

print("
 Numero di record trovati =  $AffectedRows 
"); 
print ("
"); 

while ($line = mysql_fetch_array($dbResult)) {

print "Titolo: $line[titolo]
"; 
print "Nome: $line[nome]
"; 
print "Cognome: $line[cognome]
"; 
}
$numero_elementi = count($line); 
print $numero_elementi; 

mysql_free_result($dbResult);