scusate ma pensavo di aver risolto, invece il problema è doppio. Il div di prima era seguito da un altro, non ci dovrebbero essere spazi tra i due div, dovrebbero essere attaccati dato che hanno margin e padding a 0, eppure non si toccano, perchè?!

div#navigation_up {
height:10px;
margin:3px 0px 0px 0px;
padding:0px;
background-color:#CCC;
line-height:0px;
}
div#navigation {
margin:0px;
padding: 0px;
background-color:#CCC;


<div id="navigation_up"></div>
<div id="navigation"></div>