premetto che di windows e virus non ne so moltissimo, visto che da 4 anni lavoro con linux, comunque tutto ciò che è java è multipiattaforma.
quella che ti suggerivo era una prova per farti vedere come funzionano i .jar, la stringa
java -jar file.jar
andrebbe digitata da console, va bene anche quella di DOS, ma devi avere la Java Virtual Machine istallata.
per la porta 8081 lo dicevo nel senso che si giustifica che un eseguibile java cerchi quella porta visto che spesso li c'è un server che è in grado di eseguirlo. Se hai un firewall bloccala.

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