Puoi selezionare ogni sezione manualmente ed attribuirle i relativi settings per il salvataggio.
Esempio:
Selezioni tutte le sezioni in b/n e gli dai "GIF - 8clr".
Poi selezioni quelle a colori e gli dai "GIF - 256clr (o quelli che bastano)", oppure "jpeg", oppure "png".
Tra quelle a colori puoi ulteriormente ditinguere tra quelle che necessitano di meno colori e, ad esempio, le foto, alle quali attribuirai una salvataggio in jpeg.
(Lo strumento è "Seleziona sezioni").

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