Lilo Non l'ho mai usato ma lo conosco abbastanza bene...
Per questo preferisco Grub...
Non c'e' tutte le vole da 're-installarlo' non devi dare nessun comando dopo aver compilato il kernel...

Con Grub lo installi la prima volta e poi sei aposto...
Modifichi con i nuovi parametri/versioni il kernel da far partire e sei aposto...

Grub.