Una pagina si puo chiudere con window.close() solo se è stata aperta con javascript, ma il nostro amico ci viene in aiuto comunque!

codice:
<script language="javascript" type="text/javascript">
function apri() {
window.open('url', 'titolo', 'width=801, height=600, resizable=no, status=no, scrollbars=NO, location=no');
window.setTimeout('window.close()',1);
// ****************;
}
</script>
<a onclick="apri()">Apri</a>

Così cliccando sul link si apre la popup e si chiude quella da cui è stata aperta al popup

ti sconsiglio di usarlo, perchè si cancella la cronologia dei bottoni avanti indietro, e puo risultare fastidioso