ma hdparm -tT /dev/hdxx

che valori ti da ?
reinstallare una gentoo comunque è anche divertente male che vada
a volte fa strani scherzi gentoo
a me mi aveva fatto un file di log di diversi gb tempo fa dai una ripulita alle varie tmp
dai un etc-update se hai delle conf vecchie
se è il problema di mozilla potrebbe essere qualche modulo di netfilter che rompe le scatole