prova così:

codice:
function controllo(inizio, tuovettore) {
 var i=0;
 while(inizio!=tuovettore.length-1) {
  for (i=inizio+1; i<tuovettore.length; i++) {
   if (tuovettore[inizio]==tuovettore[i]) {
    alert("C'è una coppia identica in posizione "+inizio+" e "+i+" (partendo da 0).");
    return true;
   }
  }
  inizio++;
 }
 alert("Non esiste una coppia identica.");
 return false;
}
la chiamata è questa:

codice:
controllo(0, vettore);
dove 0 è l'indice del primo elemento del vettore.

ciao