Secondo me dovresti editare il file /etc/xorg.conf e da li imposti la risoluzione voluta...
Devi andare a modificare la riga Modes che dovrebbe essere così:

Modes "1280x1024" "1024x768" "800x600"

In questo modo la risoluzione di default è 1280x1024 e puoi comunque switchare alle altre due risoluzioni!
Ovviamente cambia le risoluzioni a seconda delle tue necessità!

Oppure ti riconfiguri il Server X laciando il comando xorgconf

Ciao