Io ho fatto così in Asp:
<%
Rnd(5)
Randomize

Dim Numero
Numero= cint(rnd * 10)
%>

<object>
<param name="allowScriptAccess" value="sameDomain" />
<param name="movie" value<%=Numero%>.swf" />
<param name="quality" value="high" />
<embed src="http://www....../Swf/<%=Numero%> .swf" quality="high" width="160" height="400" name="<%=Numero%> " align="middle" allowScriptAccess="sameDomain" type="application/x-shockwave-flash" pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer" />
</object>


Ovviamente però questo vale solo se i tuoi banner hanno la stessa grandezza in width ed height