I file JAR hanno una particolarità: alcuni applicativi associano a tale tipo di file l'esecuzione automatica della JVM per avviarne l'applicazione in esso contenuta, semplicemente con un doppio clic.
Per ottenere questa funzionalità occorre includere all'interno dell'archivio jar un apposito file di testo (detto manifest) che specifica alla java virtual machine qual'è la classe che contiene il metodo main tra quelle incluse nel jar.