Io seguendo questo articolo:
http://freephp.html.it/articoli/view_articolo.asp?id=61
ho trasformato ogni url in questo modo:

pag.php?id=1&hdden=yes -> pagina.php/id/1/hidden/yes

Segui passo passo l'articolo che ti ho postato e vedrai che non incontrerai nessun problema.