Hai due modi: traslare in unix timestamp in php oppure nella query.

devi sempre pero' fare un explode della data. Facciamo finta sia:
codice:
data = '29/09/2004';
list($giorno, $mese, $anno) = explode('/', $data); 
$data=mktime("0", "0", "0", $mese, $giorno, $anno);

INSERT INTO tabella (data, altro) VALUES
('$data','$altro')
Se invece vuoi convertirla nella query:
codice:
 
data = '29/09/2004';
list($giorno, $mese, $anno) = explode('/', $data); 
$data ="$anno-$mese-$giorno";

INSERT INTO tabella (data, altro) VALUES
(unix_timestamp('$data'),'altro')