quello di cui hai bisogno è un sistema di "single sign-on" e lo puoi ottenere in vari modi , te la faccio sintetica e credo in ordine di difficoltà:
1)se hai (purtoppo) un dominio AD con win200x puoi agganciare il tuo server a esso e configurare dai moduli pam ai servizi per accetatare solo una singola passwsord
2) Puoi replicare un ADS con samba + kerberos + OpenLDAP e congiurare il tutto
3) Configuri LDAP + Kerberos , ma non so come agganciarci i client Microzozz
3) puoi configurare samba come PDC e copnfigurare il tutto
4) se hai server e client UNIX-like configurare il servizio NIS (yp , yellowpage)

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