ma che distro usi ?

per installarlo non ti conviene dare make mrproper perche ripulisce tutte le configurazioni gia fatte

basta solo

make menuconfig
make
make modules_install

in molte distro se dai un
make install

ti mette tutto quanto automaticamente in /boot e tu non devi fare altro che aggiungere prima il vmlinuz-2.6.8.1 a lilo o grub