Esatto:
Devi metterla nella head della pagina madre, e chiamarla al posto dei tuoi window.open dentro i vari link.

Ora non so esasttamente come sono fatti i richiami a window.open nella tua pagina, per cui i dettagli potrebbero essere diversi (magari hai gia` una funzine unica, ed allora basta che aggiungi il loop che da` il focus.