Forse mi sbaglio, ma dovresti compilare il php con supporto per apache...
./configure \
--opzioni che vuoi \
--with-apache /path/to/apache/source

Poi non so se č necessario ricompilare apache...
A manina devi aggiungere poi nell'httpd.conf i mime type per le estensioni php, come č gią fatto per i gz (mi sembra)...