per il mouse prova a mettere queste due righe

Option "Emulate3Buttons" "true"
Option "ZAxisMapping" "4 5"

per l'altro problema non ne ho idea metti nelle use le gtk2 qt kde e le varie use per png jpeg e prova a riemergere le applicazioni
emerge qt kdelibs wxGTK gtk+ gtkglarea gtk-perl xmms e firefox
sembra un problema grave parecchio