Che io sappia le classi della tua applicazione non le devi mettere in common (che sta "sopra" il posto in cui avresti diritti di scrittura in un server web reale) ma in webapps/tuaWebapp/web-inf/classes.
Eventualmente se si tratta di una servlet gli devi dare anche pattern e mapping nel file web.xml
le classi le ho messe proprio nella cartella WEB-INF/classes divise in package e non mi danno problemi (la maggiorparte di esse funzionano!) il problema è che il contenitore mi da sempre lo stesso errore:

java.lang.NoClassDefFoundError: COM/ibm/db2/jdbc/app/DB2Driver

che è il driver del Database che uso (IBM DB2).
Le librerie relative a questo driver (db2java.zip e db2jcc.jar) sono salvate nella cartella common/lib di TOMCAT, tuttavia continuo a ricevere quell'errore!
Spero possa aiutarmi ugualmente.

Comunque grazie infinite della tua risposta