Mi dispiace ma non c'è alcun modo!
Proprio per il fatto che deve diventare un video non necessità di interattività!
L'unica soluzione è creare tutto nella timeline principale.
Ho notato però che i moviclip annidati vengono visti ma, naturalmente, non potendoti fermare con uno stop devi farne un uso più che intelligente.
Io, ad esempio, ho dovuto creare un mini cartone animato e il movieclip, con il movimento degli occhi, è venuto perfettamente ma, del resto, è stato facile inserirlo visto che era un'animazione indipendente dal filmato principale.