apache 1.3 perchè la 2 non è stabile con php [a meno che non vuoi fare esperimenti]

php5 non da problemi di sorta al momento anche se è sconsigliabile usarlo già sui server.. ma per lavorare in locale va benissimo.. e difficilmente, a meno che non usi gli oggetti, avrai problemi di incompatibilità con il tuo server php4 (recente)

per mysql l'ultima release stabile va bene ^_^