Su bugzilla non ci sono bug aperti per ora.
Comunque mi hanno spiegato che basta editare il file Locations.xml che dovrebbe essere in:

/usr/share/gweather/
Per Milano Linate ho aggiunto questa parte:

<region>
<name>Europe</name>
<name xml:lang="it">Europa</name>
<country>
<name>Italy</name>
<name xml:lang="it">Italia</name>
<location>
<name>Milano</name>
<name xml:lang="it">Milano Linate</name>
<code>LIML</code>
</location>
</country>
</region>
Dovrebbe funzionare.