per qualsiasi distro il comando per convertire da ext2 a ext3 preservando i dati e'
tune2fs -j /dev/hdXY
dove XY sono unita' e numero della partizione, l'ext3 non e' altro che un ext2 col journaling; poi occorre aggiornare /etc/fstab di conseguenza indicando ext3 al posto di ext2, e ovviamente devi avere il supporto nel kernel
e' normale che ti trovi delle dipendenze, con apt-get install mozilla-firefox ti tira giu' tutto il necessario purche' in /etc/apt/source.list tu abbia inserito i repository corretti
quale pacchetto in particolare ti viene segnalato come rotto?