qualcosa del genere:
codice:
<script>
function  chiudi(){
document.getElementById('div1').style.visibility='hidden';

}
</script>
<div style="border:1px solid red" id="div1">ciao questo č il div di prova</div>

<div onmouseover="setTimeout('chiudi()',5000);">passa qui sopra e dopo 5 secondi scompare il div</div>