Premetto che non so come si tirano fuori tutte le righe di un file di testo. Ma intuitivamente so che ci vuole un ciclo. + precisamnete un while. Allora
$counter=0;
while (finké non finisce il file){
/* questo lo fai così se la prima riga è la numero 0 altrimenti mettici 1 al posto di 0. Fai una prova per vedere cosa esce. */
if ($counter % 2==0){
$variabile_riga="" . $variabile_riga . "";
}
$counter++
}
variabile riga è la variabile che contiene la riga di testo che estrai. Come ho detto prima non so quali funzioni si usano.