Ciao..

Punto uno
Dovresti specificare se i due server debian che hai hanno apache installato..

Punto due
Dovresti specificare se i due server hanno un firewall installato.. anche un seplice iptables --DROP

Punto tre e più importante
Dovresti avere un indirizzo IP statito assegnatoti dal provider..

Se il tuo scopo è dal server A navigare all'interno del sito dell'intranet del server B e viceversa è semplicissimo...

Stessa cosa se divi fare FTP, comunque presumo vadi anche SAMBA, ed NFS.. l'unica cosa molto importante è avere l'IP statico in quanto dovresti diventare matto a configurare i due server con indirizzi ogni volta diversi...

L'importante è che fai un buon FIREWALL e apri le porte giuste..metti una password anche per entrare in APACHE..

apache porta 80
webmin porta 10000
cups porta 631
samba porta 137,138,139
samba con win2K anche 445

Poi non so.. arrivo fin qui..
Ciao