No infatti non ci avevo pensato!...Cmq. Ora l'ho fatto ma il risultato non è cambiato.
Il percorso in Synaptic è:

Settings>Preference

poi vado sul label del menù "Network" e qui ho spuntato l'opzione "Manual Proxy Configuration"...quindi in "HTTP proxy" ho settato il nostro proxy con il numero di porta ad esso associato. ...Risultato ...nada...de nada..!!!
Peccato!...credevo di risolvere...anche perchè in Windows l'unico modo per esempio di usare il Download Manager Flashget è appunto di settare la configurazione manuale del proxy con i parametri che conosco.