1)
_root.collegamenti._x = 2;
_root.collegamenti._y = 65;

2)
Con molta probalità la profondità dei bottoni va a sovrapporsi a quella di collagementi, all'inizio dell'attach dei bottoni il primo bottone e collegamente hanno la stesa profondità, devi fare in modo che siano diverse, poi per assegnare i valori non utilizzare
links.attachMovie("pulsante","pulsante"+i, i);
ma utilizza _root.collegamenti, così anche per le altre assegnazioni, è più sicuro. Potresti provare con
var link=_root.collegamenti
e poi utilizzi link come facevi tu, ma non sono sicuro che funziona