dovresti dare qualche particolare in più, oltre a scrivere in maniera un pò più chiara.

Tieni presente che solo i CGI vanno in cgi-bin, gli script php vanno nelle directory normali.

Ti viene segnalato qualche errore specifico?

hai, tramite qualche pannello di controllo del server, la possibilità di leggere il file error_log di apache?
In tal caso cosa riporta dopo avere eseguito lo script?