presumo tu abbia fatto la scansione dalla modalità provvisoria?!?
Verifica se è presente nel disco il file index.exe, nel caso vi fosse è da attribuire a lui la principale causa dell'infezione. Ti ricordo inoltre che il trojan Collected.AE è sintomo d'infezione da Sasser.
Controlla che nella cartella PREFECHT non siano presenti i files:
INDEX.EXE-26720087.pf
IUS.EXE-15169AAC.pf
FTP.EXE-0FFFB5A3.pf
nel caso li elimini, sempre dalla provvisoria.
Ricordati, se già non l'hai fatto, di svuotare il contenuto delle cartelle TEMP, cookies e soprattutto Temporary internet files proprio in questa cartella potrebbero trovarsi files infetti, ad es.
index[1].exe
x[1].exe


Infine sarebbe utilie sapere nelle chiavi Run (almeno) quali sono i processi attivi, meglio se riesci a fare uno screenshot