L'array lo puoi scorrere con "foreach" e fare qualche cosa del genere:

foreach ($clienti as $temp)
{
$query "UPDATE tabella SET pagato='0' WHERE id = $temp";
$result = mysql_query($query);
if (!$result) die ("Impossibile aggiornare il cliente \"$temp\ "".mysql_error());
echo "Aggiornamento effetuato con successo"
}

In questo modo per ogni elemento dell'array effettui la query di aggiornamento corrispondente.

CIAU CIAU