codice:
if (password.value == confermapassword.value) {
   // fai quello che devi fare
}
Ovviamente password e confermapassword sono variabili che contengono il riferimento agli oggetti input text.

Non ti conviene usare
codice:
document.ciao.value
per ottenere il valore di un oggetto con id ciao, piuttosto usa questa soluzione standard (e che funziona anche per browser diversi da IE):
codice:
document.getElementById("ciao").value