Il discorso è molto semplice:
- o rinunci alla validazione
- o rinunci a fargli aggiornare il sito.

Entrambe le cose sono ASSOLUTAMENTE impossibili, a meno che non lo fai completamente dinamico.
Basta un niente x non passare una validazione, inoltre dare il tuo codice in pasto a incompetenti non solo perderesti il certificato w3c ma rischieresti di trovarti di fronte ai + classici errori da dilettanti (link rotti, immagini pesantissime ecc...).

MAI PERMETTERE DI MODIFICARE IL TUO CODICE.
A me è già sucesso e ho mandato a quel paese il cliente dopo la quarta volta che mi ha supplicato di correggere tutti i suoi errori sul mio codice. Perdevo + tempo a individuarli e correggerli che a rifarne uno intero da capo.