per esattezza:
"This is perl, v5.8.3 built for i386-linux-thread-multi"

Quindi in perdoc all'indirizzo:
http://www.perldoc.com/perl5.8.4/pod...html#OPERATORS
per la versione 5.8.4, dove si parla degli operatori (\i \s \m ...) si dice:
<< s match as a Single line - . matches \n >>

quindi come pensavo; allora perchè i seguenti risultati?

/\|$ref.?$/i # SI (ma per ogni carattere finale)
/\|$ref./is # NATURALMENTE SI (ma funzionerebbe per ogni carattere seguito da infiniti altri)
/\|$ref.$/is # NATURALMENTE SI (ma funz. con ogni carattere finale)

/\|$ref\n/is # NO
e per provarle tutte... (ma ne ho provate anche altre)
/\|$ref\n/im # NO
/\|$ref$/im # NO
/\|$ref\n$/im # NO

Risultato: