Ciao Nicola,

da dove apri il popup? dalla finestra principale o dall'iframe?
se la popup è stata aperta dall'iframe basta
codice:
<input type="button" value="ricarica" onclick="if(window.opener)window.opener.location.reload();">
se la popup è stata aperta dalla finestra madre
codice:
<input type="button" value="ricarica" onclick="if(window.opener)window.opener.parent.NomeIFrame.location.reload();">