Ma allora forse nessuno ha capito quello che cerchi...
Ricapitoliamo: se io apro 2 o più file PDF, Acrobat (sia il Reader che la versione "writer") non aprono più istanze del programma ma semplicemente aprono il documento "dentro" la stessa istanza. In questo modo con il menu Finestra io posso passare da uno all'altro.

Se invece (ed è quello che avevo capito io e forse tutti gli altri) io voglio poter aprire più istanze di Acrobat, indipendenti l'una dall'altra, devo usare il parametro /n

Come ti dicevo io ho provato con "acrobat.exe /n" e mi ha aperto una istanza (da cui poi, con file - apri - ho aprto un documento pdf)

Facendo nuovamente "acrobat /n" mi ha aperto un'altra istanza (indipendente dalla precedente) ed ancora una volta con file - apri - ho aperto il file che volevo. Adesso ho 2 documenti pdf aperti in due istanze diverse (e non passo quindi da uno all'altro con "finestra", ma semmai con alt-tab.

Questo è quello che ho capito io....prova a spiegare meglio quello che cerchi tu...