ma ha messo in /etc/init.d hotkeys ?

se nn ci fosse devi fare un link in /etc/init.d a

/usr/bin/hotkeys
poi ridare l'rc-update
magari scegli la tastiera nel file di conf

/etc/hotkeys.conf cosi la carica al caricamento di xserver altrimenti la devi riscegliere manualmente ogni volta

non devi andare ad init 3 per farlo partire

dai un occhiatina anche al man hotkeys