Il problema è che non avviene il refresh della pagina:

provo a spiegarmi meglio

pagina.php:
include un js che contiene l'array del menu (menu.js)
è incaricata di gestire le modifiche/aggiunte/eliminazione delle voci di menu
alla conferma (con submit) apre ...

scrivi.php:
che sostituisce il nuovo file menu.js
il tasto continua ricarica la pagina pagina.php (con submit, actionagina.php)
fin qui tutto ok

pagina.php:
mostra il nuovo menu solo dopo aver richesto il refresh da browser (ie6) !!!!