Aprire una popup è un'azione javascript. Quindi quell'azione viene compiuta quando il php ha già finito di elaborare la pagina html e che i dati della pagina sono già stati mùandati al client (il browser)... dunque php non c'entra !!!!
Riguardo al tuo problema, basta mettere
alla fine della pagina, nell'evento onload del body della pagina, oppure dove vuoi nel codice.codice:<script language="JavaScript" type="text/javascript"> <!-- ApriPopup('popup_cancella.html',400,100); //--> </script>