se sei in windows il nome del direttorio puo' essere sia maiuscolo che minuscolo. Se una stringa e' commentata (rem) viene saltata dal parser. Nel caso del file php.ini il carattere di commento e' il punto e virgola. Quindi togliere il punto e virgola ad inizio riga se vuoi che la riga sia interpretata. Nello script il carattere di commento potra' essere indifferentemente // o # oppure /* per blocchi */

es. di include:

include_path=".;C:\Php\pear;C:\php\includes;C:\php ;"

In pratica devi indicare dove si trovano i file da utilizzare...