i cavi di alimentazione e dati sembrano quelli corretti (ti sconsiglio di metterlo sotto il lettore dvd perchè con il bus ci arrivi male, ma comunque vedi tu).

per i jumper credo sia analogo: o metti come hai detto giustamente (non sono dei maxtor vero?) il master su master e lo slave su slave oppure entrambi su cs (cable selct) lasciando automatica la scelta (mai provato ma dovrebbe funzionare).
anche il bois a regola dovrebbe vedere tutto da sè, altrimenti aggiustalo manualmente.

limiti, se ce ne sono, riguardano il 48-bit LBA (Logical Block Addressing), indirizzamento che non permette di superare i 128GB. sicuramente devi avere un p4 ed inoltre abilitare il supporto (trovi molto in rete).

infine se la tuo motherboard supporta il sata (non ho controllato) puoi scegliere se continuare ad assemblare dischi ide/eide/pata (parallel ata 133) o utilizzare i connettori sata (serial ata 150).

[edit]doppia risposta[/edit]