Il problema e' che rimane presente nei servizi un daemon MySQL che impedisce l'avvio di un altro.

Prova a disabilitarlo. E' nei servizi. Poi rilanci il wizard di configurazione e vedrai che andra' bene. dopo di che utilizzando MySQL administrator potrai rimuovere definitivamente il servizio MySQL non utilizzato.

Ti consiglio di utilizzare il path di default che ti propone l'installer. Avrai il notevole vantaggio di poter fare gli aggiornamenti senza modificare una virgola dell'installazione e utilizzare sempre lo stesso servizio su WIN.