Non e` facile seguirti.

Non e` che vuoi una serie di checkbox per caso? (piu` o meno intabellate).
Se hanno tutte lo stesso nome diventano una collezione.
Se usi PHP e hanno nome che termina con [] vengono acquisite in una matrice (mi pare).

Eventualmente si puo` pensare ad uno script che limita il numero totale di checkbox selezionate, o esegue delle operazioni dopo ogni click.