anch'io ho trovato difficoltà nell'installare VEP su eclipse.
Dopo ho avuto la fortuna di trovarlo allegato su un ioprogrammo(n. 84) con tutte le dipendenze pronte, bastava scompattare ed incollare.

Quello che ti serve è(apparte Eclipse ovviamente):

emf-sdo-runtime-2.0.0.zip
GEF-runtime-3.0.zip
VE-runtime-I20040721.zip

Io l'ho usato sempre e solo su Eclipse 3.0 e 3.0 M9, non so es funziona con le altre versioni.
Per farlo andare mi sembra che DEVI essere connesso a internet visto che si basa su una JVM remota. Quando ho provato ad usarlo off-line veniva dato errore di "JVM terminated too soon".