Il consiglio è di usare MySql, se non altro perchè al 99,9% lo troverai sul server che ospiterà il sito, mentre per altri db la diffusione è assai inferiore.
A parte questo, il problema vero è un altro: d'accordo non sapere nulla di MySql, ma di sql in generale cosa sai? Di come si struttura un database? della normalizzazione dei dati? Se non conosci questi concetti è meglio che l'e-commerce lo faccia sviluppare a qualcun altro