entro i limiti, considerando che ci sara' il file principale di gestione e che una 777 non e' sicura, per ogni apertura del file dovrai fare un
if( file_exists( 'cartella/main.structure.php' ) ) ...
con relativa ricreazione presa da un' altra parte in caso di false

... e a questo punto tra una query su tabella main_includes a singolo campo text e tutti sti' controlli fai un po' tu cosa e' meglio ...


non e' una query su SELECT semplicissima a comportare calo di prestazioni, sicuramente avrai moltissime altre gatte da pelare per ottimizzare le tue performance ... imho stai perdendo tempo dietro l'ultimo ostacolo alle performance dell' applicativo