Lo spazio non è tra i tr, ma all'interno delle singole celle. Ciò è dovuto al fatto che vai a capo tra l'elemento e la chiusura del td (IE lo legge come uno spazio).

Prova così:
codice:
<table align="center" width="750" cellpadding="0" cellspacing="0" border="1">
  <tr> 
    <td valign="bottom">[img]web-logo.jpg[/img]</td>
    <td valign="bottom">[img]web-mondodx.jpg[/img]</td>
  </tr>
  <tr>
	<td colspan="2" valign="top">[img]web-barrasup.jpg[/img]</td>
	</tr>
</table>