Se il modulo php è stato compilato con il supporto FTP penso di sì, che sia possibile...nel senso che i permessi sono usati dal server solo come risposta al protocollo HTTP e quindi con l'FTP li ignori.

Su php.net c'è un gran numero di applicazioni malate


Alcuni addiritturra hanno implementato dei semplici client FTP in locale per farsi gli upload automaticamente.