Io ho trovato questo , dovrebbe esserti utile.

in più ho trovato anche questo:


Se W98 è installato su c:, tipicamente quindi sulla
partizione attiva, rimuovendo la partizione in questione si andrebbero a perdere anche i files necessari per l'avvio di W2K.
Una volta corretto il "boot.ini", è sufficiente cancellare la cartella di W98 "c:\windows".